我國現行企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策和制度存在著較大的矛盾問題，主要是：

    　1.稅收優(yōu)惠多、亂、濫。內外資企業(yè)所得稅的優(yōu)惠政策措施，遍及稅率、減免稅、應稅所得計算扣除等各個方面，范圍廣、種類多，且變動繁、金額大、透明度少。每年各類、各項減免稅實際金融究竟有多少，很難統(tǒng)計，各類、各項減免稅取得何種實際效益更難測算。這不但導致稅負不公，也影響財政收入，不適應市場經濟運行機制的要求。

   　 2.稅收優(yōu)惠的方向、目標不夠適應經濟結構調整、科技進步和社會經濟發(fā)展目標的要求。現行對內資企業(yè)的所得稅優(yōu)惠，是側重在社會福利、勞動就業(yè)、環(huán)境保護、校辦企業(yè)、勞務服務和“老、少、邊、窮”地區(qū)以及遭受自然災害等方面，多系照顧扶助性質，屬于產業(yè)激勵方面的優(yōu)惠較少。外資經營企業(yè)所得稅優(yōu)惠，則是在普遍優(yōu)惠的基礎上，把優(yōu)惠的重點放在特定不同地區(qū)的投資。雖然也結合實施了產業(yè)優(yōu)惠，但卻未能較好地區(qū)別不同類別的產業(yè)、規(guī)模、風險，進行區(qū)別對待，以致境外一些低品位的中小企業(yè)乘機涌入，許多都是規(guī)模小、技術含量少、污染大，投資期短的勞動密集型項目、服務性項目。

    　3.內外資企業(yè)稅收優(yōu)惠差別大。外資經營企業(yè)是實施普遍優(yōu)惠，優(yōu)惠的范圍廣，種類多，期限長，力度大；而對比內資企業(yè)則是差距很大�，F對外資經營企業(yè)優(yōu)惠的金額，約為已征稅款的兩倍，而內資企業(yè)的前項比例，只約為50％，兩者差距達4倍之多，影響了內資企業(yè)在市場經濟中的公平競爭。

   　 4.現行稅收優(yōu)惠不適應WTO規(guī)則，要采取“遵循與利用相結合”的原則要求。一方面，對外資經營企業(yè)實施高于內資企業(yè)的稅收優(yōu)惠，雖并未違背WTO規(guī)則，但現行有些項目，還是涉嫌有違WTO規(guī)則的，例如涉外稅法細則規(guī)定，外商投資出口企業(yè)依法減稅期滿后，凡當年出口產品值達到企業(yè)產品值70％以上的，按法定稅率減半征收所得稅。這屬于WTO規(guī)則明確列舉的以出口業(yè)績?yōu)闂l件的禁止性所得稅減免補貼；另外，中國進出口銀行和中保財險公司的出口信用保險業(yè)務，實施“先征后返”的所得稅優(yōu)惠，是一種專向性補貼，對其他企業(yè)包括外資經營企業(yè)在內都不適用，這是不公平待遇，也與WTO規(guī)則要求不符。再一個是WTO規(guī)則有關條款，準許在稅收上支持農業(yè)、科研技術活動、中小企業(yè)、貧困地區(qū)、社會失業(yè)救濟、醫(yī)療衛(wèi)生等，而我們則尚未充分利用這類有關規(guī)定，來促進我國社會經濟發(fā)展。

    針對以上矛盾，調整完善企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策的原則主要是：1.堅持產業(yè)政策為主，區(qū)域、外資政策為輔，并有機結合的稅收優(yōu)惠政策原則，對產業(yè)政策鼓勵發(fā)展的高新技術產業(yè)，農業(yè)、林業(yè)、牧業(yè)，能源、交通、通訊、水利等基礎產業(yè)和基礎設施，國家比較優(yōu)勢產業(yè)、幼稚產業(yè)、環(huán)保產業(yè)，某些第三產業(yè)和資源綜合利用項目，以及國家政策鼓勵的其他產業(yè)，區(qū)別不同情況，給以不同層次和形式的稅收優(yōu)惠。區(qū)域優(yōu)惠主要是貫徹西部大開發(fā)戰(zhàn)略決策，對西部地區(qū)，除享受全國同樣的產業(yè)稅收優(yōu)惠政策外，對在該有關地區(qū)內需要鼓勵發(fā)展的，還應給予更多一些稅收優(yōu)惠，并要授予省級政府一定的機動處置權。外資經營企業(yè)稅收優(yōu)惠，是在與內資企業(yè)同等產業(yè)優(yōu)惠的基礎上，只對中國特別需要的外資項目，另外再給一些有限度的稅收優(yōu)惠。這就是只對符合法定的產業(yè)優(yōu)惠條件，外商投資額大、技術先進、投資回收期長的外商投資企業(yè)，經營期在10年以上的，可在一般優(yōu)惠的基礎上，再適當放寬一些優(yōu)惠，以利于吸引先進工業(yè)國家的長期大額投資和高新技術，優(yōu)化經濟結構。

    　2.依據前述原則，要對現行兩稅優(yōu)惠政策措施，進行全面清理整頓，大刀闊斧地取消一切不合時宜的優(yōu)惠項目和規(guī)定，并明文公布。對取消優(yōu)惠后存在困難而又必須扶植的社會福利等企事業(yè)，改為財政撥款形式，效果似可更好一些。東部沿海地區(qū)已逐漸富裕起來，原有分地區(qū)的稅收優(yōu)惠，要改為轉向產業(yè)導向、生態(tài)平衡和集約化經營等項目開發(fā)為重點的稅收優(yōu)惠�，F行外商投資經營企業(yè)不符合新稅法政策原則的優(yōu)惠都要取消，為保持政策的連續(xù)性、穩(wěn)定性，避免震動過大，對新稅法頒布前成立的外資經營企業(yè)，過去已承諾的減免稅優(yōu)惠，可規(guī)定一個過渡期，對其稅負超過原有負擔的部分，采取“先征后返”的辦法進行過渡。外商是否投資，決定于一國政治、經濟、資源、交通、信息等多方面的投資環(huán)境因素，稅收只是其中排名較后的一個因素，取消過多的不合理稅收優(yōu)惠，而對中國產業(yè)政策急需的投資項目，仍給予某些高于內資企業(yè)的稅收優(yōu)惠待遇，在加入WTO、外資大量涌入的形勢下，是不會造成消極影響的。3.借鑒國際通行做法，要把現行基本上是直接減免稅優(yōu)惠方式，逐漸改為加速折舊、投資抵免、專項扣抵、稅前扣除等間接優(yōu)惠方式。其中加速折舊的優(yōu)惠方式，要特別重視運用，它有利于有針對性地促進技術進步創(chuàng)新、更新技術設備產業(yè)升級換代；而且從長期來看，它只是一定期間內的延緩收稅，而不會減少稅收收入。OECD(經濟合作與發(fā)展組織)在2002年3月公布了一份有關中國經濟發(fā)展的綜合報告，為中國稅制改革完善，提出五條建議，其中第一條就是：“引進任何新的稅收鼓勵措施都要謹慎，多用加速折舊法代替減免法”。

    　4.嚴格實行稅收優(yōu)惠的總量控制和效益控制。稅收優(yōu)惠實際是一種特殊的財政支出方式，必須把稅收優(yōu)惠金額控制在一個適當限度內，在這個限度內確定實施優(yōu)惠的項目和金額，以利于國家的宏觀調控。要著重考察和發(fā)揮稅收優(yōu)惠的投入產出效應，對稅收優(yōu)惠要附加必要的制約條件，特別是可以借鑒經濟發(fā)達國家的成功經驗，采取“稅式支出”制度，便利國家通過財政預算，更好地核算和控制稅收優(yōu)惠導致的稅款損失，并評價由此而取得的經濟效益和社會效益，以利于促進經濟的持續(xù)、穩(wěn)定、健康發(fā)展。

    　5.單獨制定公布統(tǒng)一的稅收優(yōu)惠法規(guī)，定期調整。鑒于國家的產業(yè)政策和有關政策，要隨著形勢發(fā)展而不斷調整，并且稅收如何貫徹有關政策、實施優(yōu)惠，需要明確具體，而稅收法律具有較長期間的穩(wěn)定性，不宜頻繁修改。借鑒世界許多國家的做法，宜于在法人所得稅法中，只明確規(guī)定優(yōu)惠的目標、原則，簡要列舉幾項要優(yōu)惠的方面，具體優(yōu)惠辦法，授權由國務院制定單獨的行政法規(guī)，以利于適應形勢發(fā)展，靈活處理，不斷調整。